近年来，霉菌病在家禽养殖生产过程中，爆发频繁、危害严重，且在很长一段时间内呈隐性流行；临床症状不明显，症状、精神状况、剖检变化呈现多样性。因此临床诊断时，极易出现事实而非，不能定性的困惑。
临床上，肉鸡发病后临床变化及剖检症状比较明显，便于总结和定性；种鸡或蛋鸡发病后，多以慢性、隐性、多样化形式出现，诊断更为困难。由于我国临床兽医、养殖户对霉菌病的不认知，该病没有及时得到预防和控制，一直长期流行至今，尤以高温潮湿最为流行，且临床症状明显，进入秋冬季节后，本病主要呈隐形感染；导致鸡群发病后，由于忽略了该病的存在，原本治辽效果很好的方案变得没有效果，给养禽业造成严重的很大的经济损失。
霉菌*素对消化道的破坏最为明显，各种*素引起的嗉囊炎，腺胃肌胃炎，肌胃角质膜增厚以及角质膜下形成溃疡；*素可造成肠粘膜脱落、坏死。这些损伤不仅严重影响机体对营养物质的消化和吸收而且造成肠道病久治不愈，反复发作。近年来常发生的肠*综合症，腺胃炎都和这些损伤有一定关系。
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霉菌*素对家禽免疫系统破坏造成的免疫抑制是它最为严重的危害，许多霉菌*素可直接破坏或降低免疫系统的结构和功能，致使胸腺萎缩，降低淋巴细胞和巨噬细胞的活性，造成体液免疫和细胞免疫障碍，严重降低免疫应答能力。生产实践中常常造成免疫后抗体达不到应有滴度甚至出现免疫失败的现象。
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霉菌*素严重影响饲料品质，直接造成动物食欲下降，采食量减少。同时干扰营养物质的吸收，抑制消化酶的活性，从而降低饲料转化率，致使饲料消耗增加，生产性能下降。另外霉菌可消耗饲料中的营养物质，降低饲料的能量水平，导致饲料的营养价值下降。
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